ETFL
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Contents:

  • 1. Quick start
  • 2. SOP for creating an ETFL model
  • 3. API Reference
ETFL
  • Docs »
  • 3.1. etfl
  • Edit on GitHub

3.1. etfl¶

3.1.1. Subpackages¶

  • 3.1.1.1. etfl.analysis
    • 3.1.1.1.1.1. etfl.analysis.dynamic
    • 3.1.1.1.1.2. etfl.analysis.summary
    • 3.1.1.1.1.3. etfl.analysis.utils
  • 3.1.1.2. etfl.core
    • 3.1.1.2.1.1. etfl.core.allocation
    • 3.1.1.2.1.2. etfl.core.carbohydrate
    • 3.1.1.2.1.3. etfl.core.dna
    • 3.1.1.2.1.4. etfl.core.enzyme
    • 3.1.1.2.1.5. etfl.core.expression
    • 3.1.1.2.1.6. etfl.core.genes
    • 3.1.1.2.1.7. etfl.core.ion
    • 3.1.1.2.1.8. etfl.core.lipid
    • 3.1.1.2.1.9. etfl.core.macromolecule
    • 3.1.1.2.1.10. etfl.core.memodel
    • 3.1.1.2.1.11. etfl.core.reactions
    • 3.1.1.2.1.12. etfl.core.rna
    • 3.1.1.2.1.13. etfl.core.thermomemodel
  • 3.1.1.3. etfl.data
    • 3.1.1.3.1.1. etfl.data.ecoli
    • 3.1.1.3.1.2. etfl.data.ecoli_utils
  • 3.1.1.4. etfl.debugging
    • 3.1.1.4.1.1. etfl.debugging.debugging
  • 3.1.1.5. etfl.integration
    • 3.1.1.5.1.1. etfl.integration.transcriptomics
  • 3.1.1.6. etfl.io
    • 3.1.1.6.1.1. etfl.io.dict
    • 3.1.1.6.1.2. etfl.io.json
  • 3.1.1.7. etfl.optim
    • 3.1.1.7.1.1. etfl.optim.config
    • 3.1.1.7.1.2. etfl.optim.constraints
    • 3.1.1.7.1.3. etfl.optim.utils
    • 3.1.1.7.1.4. etfl.optim.variables
  • 3.1.1.8. etfl.tests
    • 3.1.1.8.1.1. etfl.tests.small_model
  • 3.1.1.9. etfl.utils
    • 3.1.1.9.1.1. etfl.utils.parsing
    • 3.1.1.9.1.2. etfl.utils.utils

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